蔬菜大棚建设设施栽培中土壤连作障碍的主要表现是土壤次生盐渍化的问题。大棚长期连作的结果还为病害的蔓延创造了条件，近几年来大棚蔬菜病虫害的种类增加，发生的频繁，不少地方蔬菜生理性病害和根结线虫也多发生，严重影响棚菜的生产。如黄瓜霜霉病、辣椒绵疫病、黄瓜根结线虫病等。一般情况下，大棚膜都是一年换一次，可在春茬蔬菜拔园后，及时深翻棚地，施足鸡粪，利用旧膜高温闷棚，这样提温慢，需延长闷棚时间，即使闷棚时间稍长一些也无妨，因为旧棚膜本来已到该换的时候了，闷棚后即可完成其使命。蔬菜大棚建设采用新膜，提温虽快，但薄膜受损也严重，因此应控制闷棚时间。一般情况下，干闷过后，换上新膜，湿闷15天即可。对于一些老棚，闷棚时间可稍长一些，但最好不要超过20天。多数棚室由十长期进行多茬次的栽培与利用，尤其是茄果类、瓜类、豆类蔬菜的长期连作以及大棚覆盖阻隔，土壤雨水淋溶少，蔬菜大棚建设土壤污染严重，肥力下降，影响蔬菜产量的提高，品质下降。  

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